E. coli DNA Ligase

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碧云天Beyotime
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    基本信息
    产品名称 E. coli DNA Ligase
    品牌 碧云天Beyotime
    货号 D7016L

    碧云天生产的E. coli DNA Ligase,即大肠杆菌DNA连接酶,由碧云天自主研发的PerfectProtein™技术平台表达、纯化获得的重组酶。E. coli DNA Ligase是一种以NAD+ (烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)为辅酶,Mg2+依赖的,催化双链DNA中5'磷酸和3'羟基之间形成磷酸二酯键,即催化双链DNA粘性末端连接或双链DNA中的缺刻修复的DNA连接酶[1]。

    E. coli DNA Ligase可催化双链DNA相邻粘性末端5'磷酸和3'羟基磷酸二酯键的形成,但常规条件下不能进行平末端双链DNA的连接。在添加10-15% PEG和适当高浓度的单价阳离子时,也可以催化平末端双链DNA的连接反应。E. coli DNA Ligase在一定温度范围内(4-37℃)均具有活性,同时可以被热失活(65℃孵育20分钟)。

    碧云天生产的E. coli DNA Ligase连接粘性末端双链线性DNA的效果请参考图1:

    图1. 碧云天生产的E. coli DNA Ligase连接粘性末端双链线性DNA的效果图。利用碧云天生产的

    BeyoFusion™ DNA Polymerase (D7220)

    ,使用两端带有Hind III酶切位点的引物对靶基因进行PCR扩增,生成两种不同长度的两端带有HindⅢ酶切位点的平末端双链线性DNA分子(900bp和600bp),随后使用碧云天

    Hind III (D6389)

    对PCR产物进行酶切,获得两端带有互补粘性末端的双链线性DNA分子,分别作为Substrate 1 (900bp)和Substrate 2 (600bp);在20µl反应体系(30mM Tris-HCl, 4mM MgCl2, 1mM DTT, 26μM NAD, 50μg/ml BSA, PH8.0 @25℃)中,分别加入400ng经PCR扩增及Hind III酶切产生的两种双链DNA片段,以及图中指定量的本产品或N公司(Competitor)的E. coli DNA Ligase,16℃孵育30分钟进行连接,然后65℃孵育20分钟以终止反应。取出10μl反应产物,加入2μl

    6X DNA Loading Buffer (D0071)

    ,然后进行2%琼脂糖凝胶电泳检测。如图所示,本产品与N公司的产品相比,具有相当的连接粘性末端双链线性DNA的效果。实际操作时不同实验条件获得的实验结果会略有差异,图中所示结果仅供参考。

    用途:粘性末端双链DNA分子的连接;双链DNA的缺刻修复;cDNA第二链合成后的克隆[2]。

    来源:纯化自携带编码E. coli DNA ligase的E. coli重组菌株。

    活性定义:One unit is defined as the amount of enzyme required to give 50% ligation of HindIII fragments of λ DNA (5' DNA termini concentration of 0.12μM, 300μg/ml) in a total reaction volume of 20μl in 30 minutes at 16℃ in 1X E. coli DNA Ligase Reaction Buffer。

    纯度:不含除E. coli DNA Ligase之外的其它种类的DNA连接酶,不含内切酶和外切酶,不含RNA酶,不含磷酸酯酶。

    酶储存液:10mM Tris-HCl, 50mM KCl, 1mM DTT, 0.1mM EDTA, 200µg/ml BSA, 50% Glycerol (pH7.4 @25℃)。

    10X Reaction Buffer: 300mM Tris-HCl, 40mM MgCl2, 260μM NAD, 10mM DTT, 500μg/ml BSA (pH8.0 @25℃)。

    失活或抑制:65℃孵育20分钟可使E. coli DNA Ligase失活。

    包装清单:
    产品编号产品名称包装
    D7016S-1E. coli DNA Ligase (10U/μl)20µl
    D7016S-210X Reaction Buffer100µl
    说明书1份

    产品编号产品名称包装
    D7016M-1E. coli DNA Ligase (10U/μl)100µl
    D7016M-210X Reaction Buffer500µl
    说明书1份

    产品编号产品名称包装
    D7016L-1E. coli DNA Ligase (10U/μl)500µl
    D7016L-210X Reaction Buffer2ml
    说明书1份
    保存条件:

    -20℃保存,两年有效。10X Reaction Buffer建议长期保存于-80℃,以延长NAD半衰期。

    注意事项:

    E. coli DNA Ligase需要以NAD (烟酰胺腺嘌呤二核苷酸) 作为辅酶,而不是像T4 DNA连接酶等以ATP为辅酶。

    E. coli DNA Ligase对于平末端片段的连接效率是极低的,对于平末端的连接建议使用T4 DNA Ligase。

    E. coli DNA Ligase的催化底物是双链DNA分子,不能用于单链DNA或RNA的连接反应。

    E. coli DNA Ligase连接反应需要以NAD作为辅助因子,10X Reaction Buffer中含有辅助因子NAD,因此10X Reaction Buffer建议长期保存于-80℃,以延长NAD半衰期。

    本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。

    为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

    使用说明:
    1.参考下表在冰浴中配制反应体系(以20μl体系为例):
    ReagentVolumeFinal Concentration
    dsDNAxμlup to 0.25μg/μl
    10X Reaction Buffer2μl1X
    E. coli DNA Ligase (10U/μl)1μl0.5U/μl
    Nuclease-free Water(17-x)μl-
    Total Volume20μl-
    注1:如果同时进行多个反应,可把上表中除底物DNA之外的所有组分预先混合,然后再分装到各反应管。
    注2:E. coli DNA Ligase使用时宜存放在冰盒内或冰浴上。
    2.轻轻震荡混匀或移液器反复吹打混匀,随后低速离心以使粘附在管壁上的液体沉淀至管底。
    3.反应条件:16℃孵育30-60分钟。
    4.终止反应:反应结束后立即将反应产物在65℃条件下孵育20分钟,以终止反应。
    5.将反应后的产物进行琼脂糖凝胶或聚丙烯凝胶电泳,拍照观察并分析连接效果。如果需要从琼脂糖凝胶中回收DNA样品,推荐使用

    D0056 DNA凝胶回收试剂盒

    ;如果需要从酶切消化反应体系中纯化DNA样品,推荐使用

    D0033 PCR纯化试剂盒/DNA纯化试剂盒


    6.其他用途请自行参考E. coli DNA Ligase的相关文献资料进行。
    常见问题:
    1.E. coli DNA Ligase和T4 DNA Ligase有什么区别?
    在推荐的使用条件下,E. coli DNA Ligase不能连接平末端DNA或RNA分子[3]。
    2.E. coli DNA Ligase能否被热失活?
    可以。将E. coli DNA Ligase在65℃条件下孵育20分钟,即可使其完全失活。
    3.应该选用哪种连接酶或连接试剂盒?
    如果需要平末端或粘性末端的快速连接,建议使用

    快速DNA连接试剂盒(D7002

    /

    D7003

    )。

    T4 DNA Ligase (D7006

    /

    D7008)

    是大多数DNA重组反应所选用的酶,可用于粘性末端(室温10分钟连接)或平末端(室温2小时或过夜)的连接。E. coli DNA Ligase对底物的选择比T4 DNA Ligase更具有特异性,如果只需要粘性末端的连接,抑制平末端或RNA分子的连接,建议使用E. coli DNA Ligase。如果实验目的是单链DNA或RNA分子的连接,建议使用

    T4 RNA Ligase (D7021)


    参考文献:
    1.Lehman IR. Science. 1974. 186(4166):790-7.
    2.Okayama H and Berg P. Mol Cell Biol. 1982. 2(2):161-70.
    3.Higgins NP and Cozzarelli NR. Methods Enzymol. 1979. 68:50-71.
    相关产品:
    产品编号产品名称包装
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    DNA Ladder (0.2-12kb, 12 bands, with BeyoRed)

    100次
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    D0163S

    BeyoGel™琼脂糖预制胶(2%, NA-Red, TAE, 8孔)

    10块
    D7016S

    E. coli DNA Ligase

    200U
    D7016M

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    200U
    D6952M

    牛痘DNA拓扑异构酶Ⅰ

    1KU
    D6952L

    牛痘DNA拓扑异构酶Ⅰ

    5KU
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    快速DNA连接试剂盒 (试用装)

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    D7002

    快速DNA连接试剂盒

    100次
    D7003

    快速DNA连接试剂盒

    500次
    D7006

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    T4 DNA Ligase

    200KU
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    Seamless Cloning Kit (无缝克隆试剂盒, 试用装)

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    Seamless Cloning Kit (无缝克隆试剂盒)

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    Seamless Cloning Kit (无缝克隆试剂盒)

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    D7018L

    PBCV-1 DNA Ligase

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    R0702M

    Universal miRNA Cloning Linker (5'腺苷化3'封闭)

    5μg
    R0621S

    T4 RNA Ligase 1 (ssRNA Ligase)

    1KU
    R0621M

    T4 RNA Ligase 1 (ssRNA Ligase)

    5KU
    R0632S

    T4 RNA Ligase 2 (dsRNA Ligase)

    1KU
    R0635S

    T4 RNA Ligase 2, truncated

    5KU
    R0635M

    T4 RNA Ligase 2, truncated

    20KU
    R0635L

    T4 RNA Ligase 2, truncated

    100KU
    SF1136-10mM

    SCR7 (DNA ligase IV抑制剂)

    10mM×0.2ml
    SF1136-5mg

    SCR7 (DNA ligase IV抑制剂)

    5mg
    SF1136-25mg

    SCR7 (DNA ligase IV抑制剂)

    25mg

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